Term
| Tre dimensionel struktur af DNA |
|
Definition
| Holdes sammen af hydrogen bindinger mellem baserne |
|
|
Term
| Komplimentære base paring |
|
Definition
| Base paring er pakket stærkt favorabelt |
|
|
Term
| DNA: Right eller left handed? |
|
Definition
|
|
Term
|
Definition
| I forhold til polariteten af den modsatte streng |
|
|
Term
|
Definition
| DNA molekyler indeholder nøjagtigt nukletiosider som er modsat(komplementær med den anden nukleotid sekvens af strengen |
|
|
Term
|
Definition
| Streng som er komplementære med nukleotid sekvensen |
|
|
Term
| Hvorfor har vi template streng? |
|
Definition
| Så cellen kan kopiere eller replikere dens genome |
|
|
Term
|
Definition
| Den komplette oplaring af informationer i organsismens DNA. Specifik al RNA molekyle og protein som bliver syntheliseret |
|
|
Term
| HVad er afgrænsningen af nuclear envelope? |
|
Definition
| 2 concentric lipider lag af membraner |
|
|
Term
| Hvad indeholder membranerne? |
|
Definition
| 1. Store nuklear pore, som transporterer molekyler imellem nucleus og cytosol. |
|
|
Term
| Nucleur encelope er direkte connected til? Og hvad er dens funktion? |
|
Definition
ER, som udskyder det fra ER til cytosol.
Funktion: Tillader proteiner at reagere med DNA koncentrationen og dermed nå ud til der hvor der er behov for proteiner |
|
|
Term
| Hver kromosom i eukaryote celle |
|
Definition
| ENkelt, lang lineær DNA molekyle med proteiner som er foldet og pakket --> Giver en mere stabil & kompakt struktur. |
|
|
Term
| Kromosomer er associseret med? Og hvorfor? |
|
Definition
| Proteiner - kræves til genexpressionen, DNA replikation, DNA repair |
|
|
Term
|
Definition
| Protein som er en DNA komplekx og stramt bundede protein |
|
|
Term
|
Definition
| Primært cirkulært, mens der er også nogle med lineært |
|
|
Term
| Bakteriel kromosom: Samme som Eukaryoute? |
|
Definition
| Nej - da den ikke har den samme struktur og derved vides der mindre om prokaryotens kromosom. |
|
|
Term
| Homologous kromosom (homolog) |
|
Definition
| Maternal og paternal kromosom |
|
|
Term
|
Definition
|
|
Term
| Human celle indeholder hvor mange kromosomer? |
|
Definition
46 kromosomer
22 par fra både mor og far.
+ kønskromosomerne som er xy i mand og xx i kvinde |
|
|
Term
|
Definition
|
|
Term
|
Definition
| Kromosomerne bliver dannet, og her vil man se dem aller tydeligst. |
|
|
Term
|
Definition
|
|
Term
|
Definition
|
|
Term
| Lineær kromosom indeholder? |
|
Definition
Centromere
2 telomeres
Replikation originer |
|
|
Term
|
Definition
| Formationen af de to datter celler |
|
|
Term
|
Definition
| Generne er udtrykt og kromosomerne replikeret. Med de to replikanter bevares sammen som par af søster kromatider |
|
|
Term
|
Definition
Der sker en deling af kromosomet, og opstår to søster kromatider i hver deres datter nuclei.
[image] |
|
|
Term
| Hver kromosom funktion er at kunne? |
|
Definition
| Kunne replikere, hvor de ny replikerede kopier skal separeres og opdeles korrekt ind i de to datter celler. |
|
|
Term
|
Definition
| En type af nukleotid sekvens er replikation orgin, hvor duplikationen af DNA begynder |
|
|
Term
| Antallet af Orgins af replikation i Eukaryote? |
|
Definition
| Der er mange, for at sikre kromosomet kan repliceret konstant |
|
|
Term
| Hvad sker det efter DNA replikationen |
|
Definition
| De to søster kromatider som former hver kromosom er fortsat hæftet sammen, når celle cyklusen sker. |
|
|
Term
| HVad vil der være til stede under DNA replikationen? |
|
Definition
| DNA sekvens: Centromere: Som tillader en kopi for hver duplikation og kondenseret kromosom at bliver trukket ind til hver datter celle under celledelingen. |
|
|
Term
|
Definition
| Protein kompleks som bliver formet ved centromere og hæfter sig til det duplikerede kromosom til mitotic spindel. |
|
|
Term
|
Definition
| Ender af kromosomer. Indeholder gentagende nukleotid sekvenser |
|
|
Term
| Kromosomerne foldning ratio? |
|
Definition
|
|
Term
| Hvorfor så tæt pakket kromosom? |
|
Definition
| SIkre en hæj organisation |
|
|
Term
| Hvilke klaser proteiner binder til DNA til at forme eukaryote kromsomer? |
|
Definition
| HIstoner og non-histone proteiner |
|
|
Term
|
Definition
| Kompleks af begge klasse protein |
|
|
Term
|
Definition
| Histoner står for kromosom pakning og kaldes for nucleosome. |
|
|
Term
|
Definition
| Skive formet core som ligger stramt rundt om DNA'et i left handed coil. |
|
|
Term
| Hvad indeholder et histone? |
|
Definition
|
|
Term
|
Definition
| Histone foldninger, som er formet ud fra tre helices connected med to loops |
|
|
Term
| Hvilke interaktioner forventes mellem DNA og histone i nucleosomet? |
|
Definition
| HYdrogen bindinger, saltbridges og hydrofobe interaktioner = derved meget stramt bundet til hinanden. |
|
|
Term
| Hvilke aa finder man hyppigst? |
|
Definition
| Lysine eller arginine - deres sidekæder er basiske og har positiv ladning |
|
|
Term
| Hvad gør det ved ladningen af aminosyren og DNA |
|
Definition
| Grundet aa Lysine og argine er positivt ladet, mens DNA er negativt ladet. SÅ vil der automatisk være en neutralisering af DNA backbone. (s. 188) |
|
|
Term
|
Definition
Kaldes for hale - som stikker ud fra DNA histone core. Halerne indeholder forskellige kovalent modifikationerne og derved føles som sticky ends så de kan intergere med andre proteiner eller dens egen nucleosome
[image] |
|
|
Term
| ATP dependent Chromatin remodeling complexes |
|
Definition
Inkluderer subunits som hydrolyzer ATP. Subunitet binder til både det dobbeltstrenget DNA og histone core af nucleosomes, hvorefter energien af ATP hydrolysis bevæger DNA'et mod histone core. Protein komplekset ændre strukturen af nucleosomet, ved at gøre DNA mindre stramt bundet til histone core (s. 190)
[image] |
|
|
Term
|
Definition
Hjælper med at fjerne histonen under ATP dependent kromatin remodeling kompleks
- Exchange of histone variants → changes in nucleosome properties
- Removal/exchange of nucleosomes |
|
|
Term
| Histone H1 aka linker histone |
|
Definition
Stort individuel core histone. Hver enkelt H1 molekyle binder til hver nukleosome under kontakt af både DNA og protein hvorved DNA frakobles nukleosomet.
[image] |
|
|
Term
|
Definition
| Cellulære og fysiologiske variationer som ikke skyldes DNA sekvens ændringer. Altså man arver egenskaber for ens forældre eller forfædre |
|
|
Term
|
Definition
| Molekylær information af molekyler --> Hjælper cellen med deling f.eks. histone modifikationer |
|
|
Term
| To typer kromatin i interfasen af eukaryote celler |
|
Definition
1. Heterokromatin - højt kondenseret kromatin --> Respression transkript
2. Euchromatin - mindre kondenseret |
|
|
Term
| Heterokromatin er rigt af? |
|
Definition
|
|
Term
|
Definition
|
|
Term
| Position effect? og Hvordan undgår vi det? |
|
Definition
Spredning af heterokromatic stadie til det originale eukromatic region. En barrier forhindre der sker spredning, men hvis der opstår en mutation, så barrieren ikke vil være der - opståes der spredning. (s. 194)
[image] |
|
|
Term
| Position effect variegation |
|
Definition
| Tab af pigment i bananfluens øje. s. 195 |
|
|
Term
Lysin acetylation og methylation er KONKURRENCE reaktioner
[image] |
|
Definition
| Histone tail er modificeret, som er intrincically disordered. Sørger for for interaktioner med andre proteiner. Lysine og acetyl kan acetylationelle hvoraf der sker en neutralisering og derved forsvinder affinitet af histone og DNA pga ladningerne. Dermed tilgængelig for transskription |
|
|
Term
|
Definition
Kombinationen af markereringen på kromatin til at attract additional proteiner, for at kunne udføre en ordentlig biologisk funktion på det rette tidspunkt
- Genkender modifikationer |
|
|
Term
|
Definition
| Arbejder sammen reader proteinet. Katalyser formationen af kovalente modifikationer |
|
|
Term
|
Definition
| Fjernelsen af histone kovalente modifikationer fra specifikke regioner af DNA f.eks. histone demethylase or histone deacetylase |
|
|
Term
|
Definition
OPstår under interfasen i mitosen, når centromere hæfter sig til spindle og der sker en bevægelsen/separerering af DNA under mitosis.
Indeholder H3 histone, samt nogle proteiner som pakker nucleosomet og former kinetochore. |
|
|
Term
|
Definition
| De største kromosomer der kendes til |
|
|
Term
|
Definition
| Indeholder altid det samme DNA sekvens. Genet som er present i DNA loopet bliver aktivt expressed |
|
|
Term
| Metode for at finde positionen af loops i interfase kromosom |
|
Definition
|
|
Term
| Model for sub-compartmentalization of the nucleus |
|
Definition
Høj koncentration af transkriptionfaktor som er tiltrukket i dette er. Det er DNA som bevæger sig, hvoraf transkriptionsfaktorene så vil binde sig - derved ikke omvendt
[image] |
|
|
